Okul, ilk olarak 1810 yılında faaliyete geçmiştir. Çeşitli binalarda kız öğrencilere yönelik eğitim yapılan okulda ilk öğretmen ve müdür olarak çalışan Sabiha Hatun (Sabiha Hanım) olması nedeniyle okulun ismi “Sabihahanım” konulmuştur. 1909 yılında şimdi bulunduğu yere okul binası yapılmış ve burada eğitim-öğretime devam edilmiştir. 

   17 Ağustos 1999 tarihinde yaşanan Marmara depreminde diğer binalar yıkılmış, şu anda eğitim verilen bina güçlendirilmiştir. Depremden sonra okul bahçesine prefabrik bina yapılmıştır. Prefabrik binada bir süre ana sınıfları, okul kütüphanesi ve okul kantini hizmet vermiştir. Okul, 1991-1992 öğretim yılı sonuna kadar ilkokul olarak eğitim-öğretime devam etmiştir. 1992-1993 öğretim yılında ilköğretim okulu olmuştur. 2012-2013 öğretim yılında okulların dönüşüm sürecinde ortaokul olarak hizmet etmeye başlamıştır. 2014-2015 eğitim-öğretim yılı itibariyle ana sınıfları ve ortaokul seviyelerinde eğitim veren okul, 2018-2019 eğitim-öğretim yılında ana sınıflarının kapanmasıyla sadece ortaokul olarak öğretime devam etmektedir.