Okulumuz ismini Milli Mücadelede büyük yararlılıklar gösteren kendisi de bir İzmirli olan, 

"yeni harfler" Bakanlığı zamanında kabul edilen Milli Eğitim Bakanı  Mustafa   Necati   Bey'den   almıştır. 

 İzmir Valisi Kazım DİRİK'in gayretiyle 1927 yılında okulumuzun temeli atılmıştır (Şimdiki Necatibey Ortaokulu). 

Bazı sebeplerden dolayı inşaatına bir yıl ara verilmiştir. 1928 yılında inşaat bitmiş ve 1929 yılında eğitim ve öğretime başlamıştır. 

Kurucu Müdür Şekür ÇAĞATAY, öğretmenler Hıfsıne Emine, Bedriye Nezine hanım ile 1929 yılında öğretime başlamıştır.

Öğrenci sayısı 224 olup ilk mezun 22 öğrenci olmuştur. 

Zamanla öğrenci sayısı artınca, 1967 yılında ek bina olarak A Blok (Şimdiki Necatibey İlkokulu) yapılmıştır. 

            1987 yılında ek bina olarak B Blok hizmete girmiştir. Aynı yıl eski bina (Şimdiki Necatibey            Ortaokulu) Vali Vecdi Gönül Ortaokulu olarak faaliyete geçmiştir. A ve B Bloklar ise Necatibey İlkokulu olarak hizmet vermiştir.

1990-1991 öğretim yılında okulumuz İlköğretim Okulu Projesi kapsamına alınınca ortaokul ile birleşip Necatibey İlköğretim Okulu adını almıştır. 

2012-2013 öğretim yılında değişen eğitim sistemi ile okulumuz Necatibey Ortaokulu olmuştur.

       Okulumuz    2023-2024  eğitim -öğretim yılında Avrupa Birliği  fonu ile yaptırılan 32 derslikli , içinde laboratuvar, resim sınıfları, müzik sınıfları, teknoloji tasarım sınıfı , fen ve teknoloji sınıfı(FETEM), yaşam becerileri   sınıfı, bilişim teknolojileri laboratuvarı , spor salonu  ve konferans salonunun da bulunduğu tam donanımlı binasında eğitim öğretime başlamıştır