Okulumuz Ortaokul olarak; Niğde’de Ortaöğretim 1901-1902 ders yılında başlamıştır. Bu tarihte beş sınıflı Sancak Lisesi olarak açılmıştır. Beş sınıfın üçü ortaokul, son ikisi lise sınıfları idi

Okulumuzun ilk Müdürü Ahmet ZEKİ Beydir. Üç yıllık bir öğretim sonunda bu bina onarımına ihtiyaç duyulduğundan; İdadi Okulu 1904-1905 ders yıllarında Binbaşı Şakir Ağa’nın Emirler mahallesindeki konağına taşınmış ve burada da başarıyla iki yıl eğitim ve öğretime devam edilmiştir.

            1906-1907 (1322-1323) Öğretim Yılının ortalarında okul, Tekel Yönetimi’nin oturduğu Tahsin Efendi’nin evine taşınmış ve ikinci Meşrutiyet’in ilanına kadar (1908) öğretime burada devam edilmiştir.

     1915 (1331) senesi birinci Teşrin’de İdadi Mektebi Leyli Sultani (Yatılı Lise) olarak eğitim ve öğretime devam etmiştir. Sınıfların beşi iptidai ve dördü tali olmak üzere dokuza çıkarılmıştır. Yatılı Lise’nin binası eski Sungurbey Sosyal Salonu, şimdiki İş Bankası’nın karşınında idi. Daha sonra okul eski Sakarya İlkokul yanı şimdiki Öğretmenevi binasına taşınmıştır.

   1923-1924 (1339-1340) Öğretim yılında okul lise olmuş, ancak 1925 yılında ortaokul olarak eğitim ve öğretime devam etmiştir.1927 yılında Ortaokula “PEDAGOJİ” sınıfları ilave edilmiştir.

1929’daokul kendi binasına taşınmıştır. Yeni binanın temeli 1918’de atılmış 3 kat olarak projelendirilerek 1930 yılında bitirilmiştir.

             1939-1940 Öğretim yılında (Müdür A.Fehmi OKAN zamanında) okula mutfak ve pansiyon binası ayrıca ilave edilmiştir. Bina 100 yataklı olarak öğrencilerin hizmetine sunulmuştur. Okul binası 1939 yılından 1943 yılına kadar ortaokul olarak kullanılmıştır.

            LİSE OLARAK; 1948 yılına kadar ortaokul binası olarak kullanılan bu bina 1949 yılında Lise’ye çevrilerek 1949 yılından itibaren orta ve lise kısımlarıyla eğitim ve öğretime açılmıştır. Niğde Lisesi olarak açılan bu binada,Daha sonra 1970’li yıllarda giderek artan öğrenci sayısı nedeniyle yeni lise binasının yapımı için girişimlerde bulunularak plan ve projelerle inşaatına başlanan yapı 1978 yılında tamamlanmıştır. 1978-1979 Öğretim yılından itibaren yeni binada Niğde Lisesi olarak eğitim ve öğretime devam edilmiştir.

Niğde Lisesi’nin yeni binasına taşınmasından sonra Cumhuriyet Ortaokulu olarak eğitim ve öğretime bu binada bir süre devam edilmiştir. Binanın onarım görmesi nedeniyle taşınan Niğde Cumhuriyet Ortaokulu 1983 yılından itibaren Niğde Lisesi binasında eğitim ve öğretime devam edilmiş, 1988-1989 Öğretim yılının Şubat ayında (2.dönem) Niğde Cumhuriyet İlköğretim Okulu olarak kendi binasına taşınmıştır. Niğde Lisesi daha sonra Niğde Atatürk Lisesi adını almıştır.

             Cumhuriyet İlköğretim Okulu’nun taşınmasından sonra boş kalan bu eski binanın bir ara yeterince sağlam olmadığı gerekçesiyle yıkılmak istenmesi, zamanın merhum Niğde Valisi Ünal ÖZGÖDEK’i çok üzmüştür. Bunun üzerine binanın yeniden sağlamlaştırılarak kazanılması için çok büyük gayret gösteren merhum Vali Ünal ÖZGÖDEK’in direktifleriyle plan ve projeler çizilmiş, bina yeniden restore edilerek eğitim ve öğretime hazır duruma getirilmiştir.

     1983-1984 Eğitim ve Öğretim yılında NİĞDE ANADOLU LİSESİ adıyla açılan bu okula zamanın Ticaret Lisesi Müdürü (merhum) Hüseyin UĞUR Vekil Müdür olarak başlamıştır.. Niğde Anadolu Lisesi ilk mezunlarını 1990-1991 Eğitim ve Öğretim Yılında vermiştir. Öğrencilerimizin Üniversite Sınavlarındaki başarıları bizim en büyük sevinç kaynağımız olmuştur.