1940 Yılında Malatya İli Akçadağ İlçesinin Hamidiye Kışlası mevkiinde Akçadağ Köy Enstitüsü olarak eğitim ve öğretime açılmış, ancak okul için yer verilmemesi nedeniyle 6 ay sonra bugünkü yeri olan ve Malatya İline 30 km, Akçadağ İlçesine 26 km uzaklıktaki Karapınar köyü sınırları içerisindeki 3180 dönümlük arazisine taşındı, sırası ile Akçadağ İlköğretmen Okulu, Akçadağ Öğretmen Lisesi isimleri ile eğitim ve öğretime devam edilmiştir. 1990-1991 Öğretim Yılından İtibaren Akçadağ Anadolu Öğretmen Lisesi statüsüne kavuşturuldu. Okul, 2014-2015 Eğitimi öğretim yılı içerisinde Anadolu Öğretmen Lisesinden, Akçadağ Fatih Fen Lisesine dönüştürülmüştür. 2018-2019 eğitim öğretim yılı içerisinde ise Proje Fen Lisesi olarak eğitim hizmeti vermeye devam etmiştir.