Kabataş Erkek Lisesi, 1908 yılında Kabataş semtinde bulunan Esma Sultan Konaklarında, daha önce kapatılmış olan Aşiret Mektebinin yerine kurulmuştur.

18 Mayıs 1908 tarihinde yedi sınıf ve 276 öğrenci ile eğitim öğretime başlayan okulun kurucusu ve ilk müdürü Aynizâde Hasan Tahsin Bey’dir.

Okul, 17 Kasım 1913 tarihinde ilkokul kısmının da açılmasıyla birlikte on iki sınıflı “Kabataş Sultanisi” hâline getirilmiştir. 1919 yılından itibaren yatılı ve gündüzlü olarak eğitim öğretimini sürdüren Kabataş Sultanisi, 1923-1924 ders yılından itibaren sultanilerin kaldırılması üzerine “Kabataş Erkek Lisesi” adını almıştır.

1928-1929 ders yılı başında, Kabataş’taki mevcut binaların yetersiz kalması nedeniyle okul; Beşiktaş Ortaköy’de, 1867-1875 yılları arasında Feriye Sarayları olarak inşa edilen günümüzdeki binalarına taşınmıştır.

1931-1932 ders yılında, Feriye Sarayları’nın kapalı manej olarak düşünülen bölümü okulun kapalı salonuna dönüştürülerek kullanılmaya başlanmıştır. 1934 yılında okul bahçesinde bulunan ve Ağalar Dairesi olarak bilinen eski bina onarılarak konferans salonu ve laboratuvarların bulunduğu kültür binası olarak hizmete açılmıştır.

Öğrenci sayısındaki artış nedeniyle 1941-1942 ders yılında okulun orta kısmı kapatılmış ve aynı binada yalnızca lise olarak eğitim öğretime devam edilmiştir. 1949 yılında ise Feriye Sarayları’nın üçüncü bölümü, o tarihe kadar Beşiktaş Ortaokulu olarak kullanılan kısmı, pansiyon binası olarak liseye devredilmiştir.

Yabancı dil eğitiminin geliştirilmesi amacıyla Kabataş Erkek Lisesi’ne farklı bir statü kazandırılması planlanmış ve okul için özel bir eğitim modeli hazırlanmıştır. Bu kapsamda Türkçe eğitim yapılması, lise öncesinde bir yıl hazırlık sınıfı bulunması ve lise sınıflarında takviyeli İngilizce eğitimi verilmesi esas alınmıştır.

1992-1993 eğitim öğretim yılında bu yeni statü kapsamında okulumuzda karma eğitime geçilmiştir. Yeni statünün sağladığı ilgiyle birlikte, il dışından okulu kazanan kız öğrencilerin talepleri doğrultusunda 1994-1995 öğretim yılından itibaren yatılı kız öğrenci kabul edilmeye başlanmıştır.

1995-1996 öğretim yılı sonunda Kabataş Erkek Lisesi, karma eğitimin ilk mezunlarını vermiştir. 1998-1999 öğretim yılından itibaren Anadolu Lisesi statüsüne alınmıştır.

2006-2007 öğretim yılında Anadolu liseleri arasında “Hazırlık + 4 yıl” eğitim uygulayan lise statüsüne kavuşmuştur.

Günümüzde Kabataş Erkek Lisesi’nde Hazırlık + 4 yıl eğitim modeli uygulanmakta; hazırlık sınıflarında birinci yabancı dil olarak İngilizce ve Almanca eğitimi verilmektedir.