1895'de Amasya Mekteb-i idadisi olarak hizmet vermiş,1926'dan itibaren Amasya ortaokulu olarak eğitim-öğretime devam etmiştir.
Lise kısmı 1954-1955'te eğitim-öğretime açılmıştır. 1993–1994 eğitim-öğretim yılında ortaokul kısmı kademeli olarak kaldırılmıştır. Şu anda Anadolu Lisesi olarak eğitim öğretime devam etmektedir.
     Halen hizmet veren binaya 2011–2012 öğretim yılı yarıyıl tatilinde taşınılmıştır.
Amasya Lisesi bugüne kadar birçoğu yurt içinde ve yurt dışında tanınmış 20.000'i aşkın mezun vermiştir.
Okulumuz 2008–2009 Eğitim-Öğretim yılından itibaren adını muhafaza ederek Anadolu Lisesine dönüşmüştür.