Osmanlı döneminde sadrazam Davutpaşa Medresesi’ne bağlı olarak dört odalı şekilde ilk mektep statüsünde eğitim vermekteydi. 1930 yılına kadar eski gazoz fabrikasının karşısındaki alanda Hobyar Okulu (Mektebi) olarak öğrenim yapmaktaydı.

 Cumhuriyetimizin 10. Yılı dolayısyla Atatürk’ün emri ile yeni yapılan on okuldan biri olan bina 1932 yılında açılışı yapılarak eğitim öğretime başlamıştır. Cumhuriyetin ilk yıllarında ise

24.Mektep olarak adlandırılmıştır.

1949 yılında numaralı okul isimlerinin değişmesi ile Hekimoğlu Ali Paşa İlkokulu ismini almıştır. Okulun adı Osmanlı padişahı ikinci Mustafa’nın Hekimbaşı olan Nuh Efendi’nin oğluna istinaden verilmiştir.

 1998 yılında sekiz yıllık kesintisiz eğitime geçilmesiyle Hekimoğlu Alipaşa İlköğretim Okulu adını almıştır. 2012 yılından itibaren ise tekrar ilkokula dönüşerek Hekimoğlu Alipaşa İlkokulu ismi ile eğitim öğretim faaliyetlerini sürdürmektedir.