Okul eski binası Ali Said Paşa’nındır. İlk olarak HADİKA-İ MAARİF adı ile özel bir okul olarak eğitim öğretime başlamıştır. Daha sonra okul binasının yetersizliği nedeniyle boşaltılmıştır. Boş kalan binaya At Pazarı’ndaki KIZ RÜŞTİYESİ nakledilmiştir. Daha sonra FATİH İNAS NUMUNE ismiyle öğretime devam etmiştir. Okul 1929’da, Millî Eğitim Müdürlüğü tarafından yıktırılıp, yerine beton bina yaptırılmış ve 1930 yılında eğitim öğretime açılarak, 15. İLKOKUL adını almıştır.

1949-1950 Eğitim Öğretim Yılında tamirat görerek, okulumuzun adı YAVUZ SELİM İLKOKULU olmuştur. Binada çatlaklar oluşması nedeniyle yıkılıp, 1960 yılında bugünkü ana binasında 1 Müdür, 1 Müdür yardımcısı, 36 sınıf ile faaliyete geçmiştir.

1995-1996 öğretim yılında okulumuzun adı YAVUZ SELİM İLKÖĞRETİM OKULU olarak değiştirilmiş, hemen yanında ilkokul olarak faaliyet gösteren Muallim Yahya İlkokulu da YAVUZ SELİM İLKÖĞRETİM OKULU’na bağlanmıştır. Aynı yıl okulumuz Müfredat Laboratuvar (MLO) Okulu kapsamına alınmış ve okulumuzda pilot uygulama başlatılmıştır.

2008 yılında büyük bir onarımdan geçirilerek deprem güçlendirilmesi yapılan okul, 2020 yılına kadar aynı yerde eğitim ve öğretim faaliyetlerine devam etmiştir.

24/02/2020 tarihinde okul boşaltılarak yıkılıp yeniden yapım işlemlerine başlanmıştır. Bu tarihten 3 Şubat 2025 tarihine kadar Atikali İlkokulu’nda misafir okul olarak eğitim vermiş, 3 Şubat 2025 itibarı ile şu anki binasında eğitim ve öğretime başlamıştır.