1930 yılında açılan okul, 1952 yılında köyde bulunan başka bir binada eğitim-öğretim faaliyetlerine devam etmiştir. 1962 yılından itibaren şu an kullanılan ilkokul binası (A Blok) hizmete girmiş olup halen aynı bina kullanılmaktadır. 1970 yılında inşa edilen lojman binası ise 2000 yılından itibaren anasınıfı (B Blok) olarak hizmet vermeye başlamıştır. 2004 yılında ilkokul binasının (A Blok) bodrum katında bulunan tuvaletler iptal edilerek kalorifer dairesi oluşturulmuş; A ve B bloklarda yeterli alan bulunmaması sebebiyle okul bahçesine bağımsız bir tuvalet binası (C Blok) yapılarak faaliyete geçirilmiştir.

İlkokul binasının (A Blok) yıpranması ve zemininin çökmesi nedeniyle 1980, 1992, 2004 ve 2010 yıllarında tadilat ve zemin tamiratı çalışmaları yapılmıştır. 2005 yılında ise arka bahçeye beton voleybol ve basketbol sahası kazandırılmıştır. Okul bahçesinin geniş ve yeşil bir alana sahip olması vesilesiyle ağaçlandırma, çimlendirme ve çevre güzelleştirme çalışmaları yapılmış olup bu faaliyetler günümüzde de devam etmektedir.

2017-2018 eğitim-öğretim yılında, kapatılan Çalca Ortaokulundan 6 adet akıllı tahta okulumuz demirbaşına aktarılarak kullanılmaya başlanmıştır. Ayrıca aynı eğitim-öğretim yılı sonunda, okulun arka bahçesine Hocalar Kaymakamlığı tarafından ahşap oyun parkı yaptırılmıştır.

Yeterli derslik ve alan bulunmaması sebebiyle okulda eksikliği hissedilen kütüphanenin yerine; 2019 yılında Afyon Kocatepe Üniversitesi öğrencileriyle yapılan iş birliği ve kitap toplama kampanyası sayesinde 400’e yakın kitap toplanarak ilkokul koridorunda "Al Götür, Oku, Getir!" isimli okul kitaplığı hizmete açılmıştır.

2018-2019 eğitim-öğretim yılında okulumuzun iç cephesi öğretmenlerimiz ve velilerimiz tarafından boyanmış, ilkokul binasına alınan LCD TV ile bir akıllı pano oluşturulmuştur. Ayrıca arka bahçede bulunan futbol sahasının çimlendirme çalışmalarına başlanmış ve "Bir Nefes Bir Fidan" projesi kapsamında bahçemize 200 adet ağaç dikilmiştir.

2025-2026 eğitim-öğretim yılı itibarıyla Yeşilhisar Yunus Emre İlkokulu; 5 derslik, 1 müdür odası, 1 öğretmenler odası, 1 depo/arşiv, 1 kazan dairesi ve 1 kömürlük ile eğitim-öğretim faaliyetlerine devam etmektedir.