Aydın Lisesi ilk kez 1927-1928 eğitim/öğretim yılı başında vilayet özel bütçesiyle "İkbal Okulu" adı altında ortaokul olarak açılmıştır. Açıldığı ilk yılda 25 kız 35 erkek olmak üzere toplam 60 öğrenci ile eğitim kurumları arasındaki yerini almıştır. Ortaokul binasının yapımı 1928 yılının Eylül ayında tamamlanmıştır. Bugün "Eski Bina" ya da "Ana Bina" olarak adlandırılan 2017 Kasım ayından itibaren eğitim tarihi müzesi olarak hizmet veren bu binanın üzerinde Osmanlı Türkçesi ile " Aydın Cumhuriyet Mektebi" yazmaktadır.  1948 yılında Aydın Ortaokulu lise olmuş ve "Aydın Lisesi" adını almıştır. Böylece okulun bünyesinde ortaokul ve lise uzun yıllar birlikte yaşamıştır. Lise olarak ilk mezununu 1951 yılında veren okulun mevcut binalarına 1954 yılında iki katlı yeni bina, şu anki ismiyle "B Blok" eklenmiştir. Daha sonra yaptırılan yeni öğrenci yurdu öğretmenevi yapılmak üzere kapatılmıştır. Bu bina öğretmenevinin 2017 yılı içinde taşınması ile şu an boş durumdadır.    27 dönümlük okul bahçesi çok geniş bir alana yayılan Aydın Lisesi 2008-2009 eğitim-öğretim yılından itibaren Anadolu Lisesi statüsünde eğitim vermeye başlamıştır.