Okulumuz 1940 yılında ilkokul olarak eğitim-öğretime başlamıştır.1977 yılında Köy Konağı olan ahşap binada eğitim-öğretime başlayan Koyunhisar Ortaokulu 1984 yılında tek katlı olarak yapılan, halen eğitim-öğretime devam ettiğimiz yeni binasına taşınmıştır.
Okulumuz 1990-1991 öğretim yılında ilköğretim okuluna dönüştürülmüştür. Bu arada yeni okul binasının ikinci katı da tamamlandığından, başlangıçta iki ayrı binada eğitim öğretimini sürdüren okulumuz tek çatı altında eğitime devam etmeye başlamıştır.
2008 yılında ana binaya ilave olarak devlet millet işbirliği ile yemekhane ve çok amaçlı salon olmak üzere iki katlı bina ilave edilmiştir.
Okulumuz adını, Osmanlı İmparatorluğunun kurtuluş döneminde sözü edilen Koyunhisar Savaşı’nın geçtiği ovada kurulan Koyunhisar Köyünden almıştır.
Halen ilk ve ortaokul olarak eğitim-öğretime devam eden okulumuzun 1. Katı ilkokul ve bölümleri 2. Katı ortaokul ve bölümlerinden oluşmaktadır.
Okul binası 8500 metrekarelik bir arsa üzerine bina edilmiştir. Okul binası 640 metrekare alan üzerine zemin kat + 1 kat halinde inşa edilmiştir.
Okulumuz taşıma merkezi okul olarak çevre köylerdeki öğrencilere eğitim-öğretim vermektedir. Okulumuza Koyunhisar, Çardak, Menteşe, Karacaali, Marmaracık, Toprakocak, Fethiye, Selimiye, Kavaklı, Yeniköy, Burcun, Kıblepınar ve Paşayayla mahallelerindeki öğrenciler taşımalı olarak eğitim almaktadır.