1. Kuruluş Dönemi (Eksere / Agonya İptidai Mektebi)

• İlk Açılış: Yerleşim yerinin eski adı olan Eksere (veya bölge adıyla Agonya) döneminde, II. Meşrutiyet reformlarının taşraya yansıdığı 1908–1911 yılları arasında ilk resmi eğitim kurumu olarak Eksere İptidai Mektebi adıyla açılmıştır.
• Milli Mücadele ve İsim Değişikliği: Kuvayı Milliye döneminde, Biga-Yenice hattında Kuva-yı İnzibatiye ve Anzavur isyanlarına karşı mücadele veren ve bölgede şehit düşen Milli Mücadele kahramanı Köprülülü Hamdi Bey'in hatırasına hürmeten, beldenin ve okulun adı Hamdibey olarak değiştirilmiştir.

2. Cumhuriyet Dönemi ve Yapısal Dönüşüm

• Tevhîd-i Tedrisat (1924): 1924 Kanunu ile iptidai mektep statüsünden çıkarılarak Hamdibey Mektebi / İlkokulu adını almıştır.
• Yeni Müfrez Binaya Geçiş: Harf Devrimi (1928) ve 1930'lu yılların başında bölgedeki okullaşma hamlesi kapsamında kâgir/taş yapı üzerine modern derslikleri olan yeni okul binası inşa edilmiş ve dönemin ihtiyaçlarına uygun hale getirilmiştir.
• İdari Bağlantı Değişikliği (1936): Yenice’nin 15 Haziran 1936’da ilçe statüsü kazanıp Balıkesir/Gönen mülki idaresinden ayrılarak Çanakkale’ye bağlanmasıyla birlikte, okul da idari yönden Çanakkale Maarif Müdürlüğü’ne bağlanmıştır.

3. Günümüzdeki Durumu

• Taşımalı Eğitim Merkezi: Çevre köylerdeki öğrenci sayısının zamanla azalması üzerine Hamdibey İlkokulu, çevredeki bağlı yerleşimlerin birleştiği bir toplama/taşımalı eğitim merkezi konumuna gelmiştir.
• Aktif Eğitim: Günümüzde Milli Eğitim Bakanlığı bünyesinde 314488 kurum kodu ile ilkokul düzeyinde kesintisiz olarak eğitim-öğretim faaliyetini sürdürmektedir.