1893 yılında Osmanlı Padişahı II. Abdülhamit zamanında Taş Mektep olarak hizmete açılan okul, uzun yıllar eğitim ve öğretime devam etmiştir. Türkiye Cumhuriyeti’nin kuruluşunun ilk yıllarında 1926-1958 yılları arasında ortaokul ve lise olarak hizmet vermiştir.

Taş Mektep, 31 Ağustos 1925 yılında Kastamonu’dan dönerken Çankırı’ya da uğrayan Gazi Mustafa Kemal ATATÜRK tarafından ziyaret edilmiş ve o zamanki tarihi özelliğiyle muhafaza edilmesi istenmiştir.

09.05.1962 yılında Türkiye’nin ilk kadın pilotu olan Sabiha GÖKÇEN ve Türk Tarih Kurumu Genel Müdürü Çankırı Lisesine (Taş Mektep) ziyarette bulunmuştur.

Çankırı Lisesi, eğitim ve öğretim kalitesi açısından ülkemizin başarılı okulları arasında yer almaktadır. Yıllar boyunca mezun olan öğrenciler, ülkemizin çeşitli kurumlarında önemli görevler üstlenmişlerdir.

1989 yılında, 4 kısım halinde açılarak öğrenci alan okul halk arasında “Süper Lise” olarak bilinmeye başlamıştır. 2005 yılı Eylül ayından itibaren Anadolu Lisesi statüsüne kavuşmuştur.

Okul, 1986-1987 eğitim öğretim yılında bulunduğu binasına taşınmıştır. Günümüzde eğitim-öğretim faaliyetlerine modern binasında devam etmektedir.