Çapa İlkokulu, 1925 yılında Fatih ilçesi Çapa semtinde, Ziya Gökalp Sokağı üzerinde Nazif Paşa Konağı’nın arsasına inşa edilen binasında eğitim öğretime başlamıştır.

1957 yılında, dönemin yol genişletme çalışmaları kapsamında okul binasının yıkılması üzerine eğitim öğretim faaliyetleri 1957-1961 yılları arasında Topkapı Kara Ahmet Paşa İlkokulunda, kendi yönetici ve öğretmen kadrosuyla sürdürülmüştür.

Çapa semtinde yapımı tamamlanan yeni okul binası 1960 yılında hizmete hazır hâle gelmiş, gerekli düzenlemelerin ardından 1961 yılından itibaren eğitim öğretim faaliyetleri bu binada devam etmiştir.

1962 yılında, Türkiye genelinde yürürlüğe giren Anaokulları ve Anasınıfları Yönetmeliği doğrultusunda okul bünyesinde anasınıfı açılarak okul öncesi eğitime başlanmıştır.

Artan eğitim ihtiyacını karşılamak amacıyla okul bahçesinde inşa edilen yeni hizmet binası 1970 yılında tamamlanmış ve eğitim öğretim faaliyetleri bu binada sürdürülmeye başlanmıştır.

1994-1995 eğitim öğretim yılında, Fındıkzade Ortaokulunun okul bünyesine katılmasıyla kurum Çapa İlköğretim Okulu adını almış ve sekiz yıllık kesintisiz eğitim sistemi kapsamında hizmet vermeye başlamıştır.

2012 yılında, 6287 sayılı Kanun ile eğitim sisteminde yapılan yeniden yapılandırma sonucunda ilkokul ve ortaokul kademeleri ayrılmış; okul yeniden Çapa İlkokulu adını alarak eğitim öğretim faaliyetlerini ilkokul statüsünde sürdürmeye devam etmiştir.

Bugün Çapa İlkokulu; köklü geçmişi, güçlü eğitim geleneği, çağdaş eğitim ortamları ve deneyimli öğretmen kadrosuyla öğrencilerini akademik, sosyal, kültürel ve sportif alanlarda geleceğe hazırlayan Fatih ilçesinin köklü eğitim kurumlarından biri olarak hizmet vermektedir.