Kurumun hizmet verdiği bina, 1789 yılında Sultan I. Abdülhamid tarafından inşa ettirilmiş olup, 1895 yılından itibaren eğitim amaçlı kullanılmaya başlanmıştır. I. Dünya Savaşı yıllarında karakol olarak hizmet veren yapı, savaş sonrasında yeniden eğitim faaliyetlerine tahsis edilmiştir.

1972 yılına kadar Teşvikiye İlkokulu olarak kullanılan bina yıkılmış, yerine çevre sakinlerinin katkılarıyla yeni bir okul binası inşa edilmiştir. 1974 yılında hizmete açılan kuruma, yapım sürecine önemli katkıda bulunan Sait Çiftçi’nin adı verilmiştir.

Kurum, 1992-1993 eğitim öğretim yılında ilköğretim okuluna dönüştürülmüş ve Sait Çiftçi İlköğretim Okulu adıyla eğitim faaliyetlerini sürdürmüştür. 2013-2014 eğitim öğretim yılında gerçekleştirilen eğitim sistemi düzenlemeleri kapsamında yeniden ilkokul statüsüne kavuşmuş ve Sait Çiftçi İlkokulu adıyla hizmet vermeye devam etmiştir.

2012 yılında mevcut bina yıkılarak yerine Şişli Belediyesi tarafından yeni bir okul binasının yapımına başlanmıştır. İnşaat çalışmaları tamamlanan bina, 23 Aralık 2013 tarihinde resmî olarak hizmete açılmıştır.