Müdürlük 1886 ve öncesinde İlköğretim Müdürlüğü olarak görev yapmaktaydı. Cide’nin kıyı kısmında halihazırda yıkılmış olan bir binada hizmet vermekte olan müdürlük 1901 yılında çarşı tarafındaki bir binaya taşınmıştır. 1983 yılında şu anda bulunduğu binaya taşınan İlçe Milli Eğitim Müdürlüğü, 1991 yılında Hükümet Konağı’na taşınmıştır. 2015 yılına kadar Hükümet Konağı’nda hizmet veren İlçe Milli Eğitim Müdürlüğü 2015 yılında tekrar şu anda bulunduğu giriş katı Cide Mesleki Eğitim Merkezi olan binaya taşınmıştır. Bina 1886 yılında Osmanlı Devleti padişahlarından II. Abdülhamid Han döneminde Hükümet Konağı olarak yapılmış ve kültür varlığı olması dolayısıyla "Sarı Tabela" ya sahiptir.