1938 Yılında İnönü Yatılı Mektebi olarak eğitime başlamıştır. 1949-1950 Öğretim yılında Taşköprü Ortaokulu olarak açılmıştır. 1968-1969 Öğretim yılında aynı binada Lise açılmış ve okulumuz Taşköprü Lisesi bünyesine alınmıştır. 1989-1990 Öğretim yılı sonuna kadar bu şekilde eğitimine devam eden okulumuz, 1990-1991 öğretim yılında Taşköprü Lise bünyesinden ayrılıp, aynı bahçede bulunan Atatürk İlkokulu ile birleşerek İlköğretim Okuluna dönüştürülmüştür.

Müdürlüğümüz 11 Nisan 2012 tarih ve 28261 sayılı Resmi Gazetede yayımlanarak yürürlüğe giren 30.03.2012 tarih ve 6287 sayılı İlköğretim Kanunu ile Bazı Kanunlarda değişiklik yapılmasına Dair Kanunun uygulanması sonucu "ATATÜRK İLKOKULU" ve "ATATÜRK ORTAOKULU" olmak üzere iki ayrı müdürlük olmuştur.