İzmit Necatibey İlkokulu’nun tarihi 19. yüzyıla dayanmaktadır. 1887 yılında Mıhitiryan Tarikatı tarafından İzmit’te Venedik Mıhitiryan Ermeni İlkokulu açılmıştır. Muhtemelen okulun yıpranması nedeniyle 1912’de istasyon karşısında Ermeni Katolik Kilisesi, Murahhashanesi ve bitişiğinde okul inşa edilmiştir. 1921-1922 tarihli kent haritalarında Ermeni Katolik Kilise ve Murahhashanesi olduğu belirtilen yapının Bahçecik’ten 1885’te Adapazarı’na, 1920’de de İzmit’e taşınan Amerikan Koleji olduğu anlaşılmaktadır.

Vali Eşref Sait döneminde (1927-1934) Amerikan Koleji restore edilerek Necatibey İlkokulu’na dönüştürülmüştür. Ancak ismi o yıllarda Necatibey İlkokulu olarak geçmemekte yerel gazete haberlerinde “İstasyon karşısındaki altıncı ilk mektep” ifadesiyle geçmektedir. Okula 1929 yılında vefat eden Milli Eğitim Bakanı Necati Bey’in adı verilmiştir. 1933’te açılan İzmit Halkevi Şubesi’nin binası olmadığından Necati Bey Okulu’nun Halkevine tahsis edilmesine karar verilmiştir.

Necatibey Okulu’nun bir bölümü uzun yıllar Milli Eğitim Müdürlüğü olarak kullanılmıştır. Okul, ayrıca şehirde müze olmadığından arkeolojik buluntuların saklanması için de kullanılmıştır. 1955 yılında D-100 karayolunun sahilden geçmesi hususunda alınan karar gereği yolun geçeceği bölümde istimlake başlanmış, deniz doldurularak Necatibey Okulu yıkılmış ve üzerinden yol geçmesi kararlaştırılmıştır. Eski Necatibey İlkokulu yerine, Kâğıt Fabrikası Stadı ile Sümer Camii arasında tekrar aynı isimle yeni bir okul inşa etme kararı alınmıştır. Okula ek olarak Yetiştirme Yurdu ve Kapalı Spor Salonu binası da inşa edilmiştir. Buranın Eğitim Enstitüsüne dönüştürülmesi nedeni ile öğrenciler Sümer İlkokulu yani şimdiki Nuh Çimento İmam Hatip Ortaokulu’na (İzmit Nuh Çimento İlköğretim Okulu) aktarılmıştır. 1983 yılında Derince Yavuz Sultan Mahallesinde inşa edilen okula NECATİ BEY ismi verilmiş böylelikle eğitim hayatının devamı sağlanmıştır. 2013 yılında ARACI Şirketler Topluluğu Yönetim Kurulu Başkanı İbrahim Vefa ARACI  tarafından babası merhum ŞÜKRÜ ARACI adına okul binası yenilenerek Şükrü Aracı İlkokulu adını almıştır.