Okul ilk olarak 1912'de Vadii Meram Mektebi olarak açılmıştır. 1926 yılında Dere İlkokulu olarak hizmete açılmıştır.  Bu yıllarda 3 derslik ve 3 yıllık eğitim veren bir kurumdu.

1946 yılında derslik sayısı artırılarak 5 dersliğe dönüştürülmüş olup 5 yıllık eğitim verilmeye başlanmıştır. 1980 yılında Dere eşrafından hayırsever vatandaşımız Mustafa Cansever kendi imkânlarıyla 3 derslik ve 1 müdür odası yaptırdı.

Okul 1972 yılından 1997 yılına kadar 6 derslik, 1 müdür odası ve 1 öğretmen odası ile eğitim hizmeti vermiştir.

1997 yılında yine Mustafa Cansever’in önderliğinde Dere eşrafından öğretmen olan Mürteza Baysal ve eşi Sabiha Baysal’ın katkılarıyla yeni okul inşaatına başlanmış, bu yıl (1997-1998) eğitim öğretim faaliyetleri Dere Cumhuriyet İlköğretim Okulunda sürdürülmüştür. 

Yeni binanın projesi okul öğretmeni Mimar Handan Baykara tarafından çizilmiş, İl Milli Eğitim Müdürlüğü inşaat bürosu tarafından tip olarak onaylanmıştır. Okul 1998 yılında Dere Zafer İlköğretim Okulu adını alarak 8 yıllık eğitim öğretim vermeye başlamıştır.

2687 sayılı İlköğretim ve Eğitim ile Bazı Kanunlarda Değişiklik Yapılmasına Dair Kanun Konya Valiliğinin 18.06.2012 tarih ve 20058 sayılı Onayı ile okul ilkokul ve ortaokul olarak ayrılmıştır.

Meram Dere Zafer İlkokulu olarak okulun üst katında eğitim öğretime devam etmiştir. 2014 yılı Ocak ayında yapılan tadilat sonucunda BT sınıfı ilgili onayı ile sınıfa dönüştürülmüştür. Ayrıca Ortaokul ile merdiven boşluklarından gerekli bölümler yapılarak tamamen bağımsız duruma getirilmiştir.

Okulumuzda şu an 1 Müdür Yardımcısı Odası, 6 derslik, 1 Öğretmenler Odası ve 5 öğretmen 2 idareci ile eğitim öğretim faaliyetlerine devam etmektedir.