Merkez İbtidai Mektebi adıyla I. Meşrutiyet döneminde geçici bir binada açıldı. Zaman içerisinde okul binası ihtiyaca cevap veremediğinden yeni bir bina yapılarak 20 Aralık 1898’de eğitim-öğretime açıldı. 

1914’te Çeşmeli Apartmanı’nın olduğu yerdeki iki katlı taş binaya taşındı. 

Millî Mücadele yıllarında Numûne Mektebi (1918-1921), Merkez Zükur Mektebi (1922-1923), Cumhuriyetin ilanından sonra ise Merkez Erkek Mektebi/Merkez İlk Erkek Mektebi isimleriyle eğitim-öğretim faaliyetlerine devam etti. 

1927 yılında Seydişehir’de eğitim öğretim alanında birtakım düzenlemelere gidildiği görülmektedir. Kent merkezinde bulunan İlk Kız Mektebi ve İlk Erkek Mektebi kapatılarak Seydişehir Muhtelit (karma) Mektebi adıyla yeni bir okul açıldı. Muhtelit Mektebi, Merkez Okulunun eğitim verdiği binada açıldı. Kız Mektebinin ve Merkez Mektebinin mevcut öğretmen kadrosu da birleştirilerek yeni okulun eğitim kadrosu bu şekilde oluşturuldu. 1934 yılında okulun adı öz Türkçecilik çalışmaları neticesinde Seydişehir Özek (Merkez) Okulu olarak değiştirildi. 

1936 yılında yapımına başlanılan üç katlı modern bina ise 1939’da tamamlanarak aynı yıl Seydişehir Merkez İlkokulu adıyla hizmete girdi. Bu bina 2008 yılına kadar hizmet vermiştir. 12.03.2009 yılında  bugünkü yeni binanın yapımı tamamlanarak 24 derslikli olarak eğitim öğretime bu binada devam edilmektedir.

Okul arşivinde Diploma Defteri 1931-1965, Foto Albümü (1980’ler), Öğretmen Sicil Defteri 1960-2007 mevcuttur.