Okul ilk olarak 1938 yılında faaliyete geçmiştir. 1940 yılında bir derslik ve bir eğitmen evi ile yeni binaya taşınmıştır. 1957 yılına kadar bu şekilde eğitim ve öğretime devam eden okul beş sınıflı olması 1961 yılında olmuş, ilk mezunlarını da 1963 yılında vermiştir. Şu an bulunduğu yerde 3 derslik ve bir lojmandan ibaret olan yeni okul 10 Kasım 1965 tarihinde eğitime açılmıştır. 1985 yılında ek olarak yapılan iki derslik ile okul beş dersliğe ulaşmıştır. 1965 yılında yapılan okul binası 2005 yılında yıkılmış ve Ocak 2006 tarihinde kaloriferli yeni okul binasına kavuşmuştur.2013 yılında Boğaz İlkokulu adını alan okul 2024 yılında Boğaz Şehit İsa Toktaş İlkokulu adını alarak eğitime devam etmektedir.