Kaptanoğlu İlkokulu 1936 yılında Limanköy İlkokulu olarak hizmete açılmış olup daha sonraki yıllarda Barbaros İlkokulu ve Kaptanoğlu İlköğretim Okulu olarak hizmet vermiştir.

1986 yılında okulun fiziki yapısında meydana gelen eksiklikleri gidermek için Kaptanoğlu Ailesi tarafından yeniden inşa edilerek Kaptanoğlu İlkokulu adını almıştır.

8 yıllık kesintisiz eğitim programı kapsamında okulun ismi Kaptanoğlu İlköğretim Okulu olarak değişmiş son düzenleme ile Kaptanoğlu İlkokulu adını almıştır.

2022 yılında tekrar Kaptanoğlu ailesi tarafından yenilenen okulumuz eğitim öğretime Anasınıfı dahil toplam 5 sınıf devam etmektedir.

Yapılan araştırmalarda okulda 1945 yılı ve öncesine ait evrak bulunamamıştır.