Okul binası ilk olarak 1911 yılında inşa edilmiş ve uzun yıllar boyunca doğrudan “Pamukova İlkokulu” ya da “Merkez İlkokulu” adıyla bölgeye eğitim vermiştir.

   Okula arsa bağışlayan, maddi yardımlarda bulunan ve çevre esnafını da yardıma teşvik ederek okulun gelişmesinde büyük rol oynayan hayırsever Fatma Ertürk (1919-2009) anısına okulun adı "Fatmahanım İlkokulu" olarak değiştirilmiştir.

   Okul binası 1956'da yenilendikten sonra 1973 yılına kadar hem ilkokul hem ortaokul olarak ortak kullanılmış, günümüzde ise yine aynı kampüste Fatmahanım İlkokulu ve Fatmahanım Ortaokulu isimleriyle bir arada hizmet vermeye devam etmektedir.