Açıkbaş Yorgi isimli bir Rum tüccar hastalanıp ölen kızının drahomasını metropolithaneye vererek Rum kızları için okulun inşasına başlamıştır. İnşaata başlandıktan sonra tahsis edilen paranın yetişmemesi yüzünden Yorgi’nin ölümünden sonra oğlu Theodoritis tarafından tamamlanarak öğretime başlamıştır.
             Okul 1308’de 5 yıllık ‘idadi’ olarak açılmıştı. İşgal yıllarına kadar Rüstem Paşa vakfında eğitim veren okul, Cumhuriyetin ilk yıllarında Cumhuriyet İlkokulu olan eski medrese binasında kalmıştır. 1909’ da 1 sınıf daha katılarak 6 yıla çıkarılmış ve 1 yıl sonra tekrar 5 yıla indirilmiştir.
           Kuruluşundan Yunan işgaline kadar ‘idadi’ olarak devam eden okulun ilk direktörü (müdürü) Ebredçi Ziya’dır. Okul işgal yıllarında eğitimine ara vermiş 1923-1924 Eğitim yılında bir dönem Hacı İlbey Okulu olarak da kullanılan binada tekrar eğitimine başlamış ve 2 ay sonra Kesriye göçmenlerinden Asaf’ın evine taşınmıştır. 1924-1925 Eğitim yılında ise şimdiki Namık Kemal İlkokulu binasına yerleşmiştir.
        İşgalden sonra ilk kısmıyla beraber 40 öğrenci olan ortaokul 1923-1924’ te 9 yıllık liseye çevrilmiş ve hemen yılbaşında ortaokul adını almıştır. İlk kısmı 1925-1926’ da kaldırılmış ve okul 1926-1927 eğitim yılında karma (erkek-kız) olmuştur.1933-1934 eğitim yılında öğrenci sayısı 256 iken 1937-1938 yıllarında bu sayının 546’ya çıktığı ve buna bağlı olarak şube sayılarının da arttığı biliniyor. Bu yıllar arasında öğretmen sayısı ise 13 ile 15 arasında değişir.
       1998 yılına kadar 5 sınıflı ilkokul olarak eğitim ve öğretime devam etmiştir.1998 yılından sonra ilköğretim olarak hal yanındaki binası 1. Kademe, müze yanındaki binası ise 2. Kademe olarak kullanılmıştır. 2014-2015 Eğitim Öğretim yılı başında 4+4+4 Eğitim Sisteminde okul tamamen ilkokula döndürülmüş olup tam gün eğitime bir adım atılarak bütünlük olması açısından 3.sınıflardan başlanarak(8 Şube) hal yanındaki bina tam güne çevrilmiştir.2015 yılı haziran ayında Müze yanındaki binanın bahçe kapısı girişinde çökme olduğu için 2015-2016 da eğitim öğretim yapılamamıştır.Kapı girişindeki çökme onarılmadığı için 2016-2017 eğitim öğretim yılına da binada eğitim verilmeden girilmiştir. Çökme sorunu çözüldükten sonra okul 2017-2018 Eğitim Öğretim Yılında normal eğitime geçmiştir. Okul bünyesinde iki bina varken, 2018-2019 Eğitim Öğretim Yılında binanın biri Ertuğrul İlkokulu olarak açılmış olup bu okuldan ayrılmıştır.